挽手话别语
新浪微博
微信
当前位置:挽手话别语网 » 园艺

Genome Biology | 中国科技大学单革等利用CRISPR技术刷新对lincRNA的生物学见解



iNature

LincRNALong intergenic non-coding RNA,是人类细胞中仅有少数转录生成的RNAs,可作为蛋白质合成的模板。其余的RNA被称为非编RNAs (ncRNAs)。它们位于编码蛋白的基因之间,其中长度超过200bpncRNAs称为lincRNAs。尽管细胞中存在大量的lincRNAs,然而长期以来它们被人们视为是转录RNAs中的暗物质,对其功能及机制均知之甚少。

201918日,中国科学技术大学单革等人Genome Biology上发表了题为Systematicevaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants的研究论文。该论文显示:通过使用CRISPR/cas9技术,产生了155株秀丽新杆线虫LincRNA的敲除株,其可作为研究非编码RNA的宝贵资源,并且研究结果为研究中鉴定的表型LincRNA提供了生物学见解。



研究人员通过表型研究这些lincRNA的基因表达模式和潜在的功能机制。一些秀丽隐杆线虫lincRNA在调节其邻近基因的表达中发挥顺式作用,并且几种lincRNA作为针对微小RNAceRNA发挥反式作用。研究人员还研究了转录因子对lincRNA表达的调节,并且剖析了两种转录因子UNC-30UNC-55共同控制linc-73表达的途径。此外,linc-73具有顺式功能以调节其邻近的驱动蛋白基因unc-104的表达,因此在秀丽隐杆线虫运动中起作用。

 

秀丽隐杆线虫lincRNA的基因组特征

 

通过使用CRISPR,研究人员已经产生了155株秀丽新杆线虫的敲除株,作为研究ncRNAs的宝贵资源。对这些株进行系统分析,仅鉴定了23lincRNA突变体的6个性状。研究人员已经描述了这些lincRNAs的表达模式、分子机制和其他调控相关性的一些方面。

通过转录因子调节lincRNA

 

通过使用CRISPR / cas9技术,研究人员生成155个秀丽隐杆线虫lincRNA的敲除株作为非编码RNA研究的宝贵资源,并且研究为23株具有本研究中鉴定的表型的LincRNA提供了生物学见解。

 

此项研究得到了中国国家基础研究计划、中国国家重点研发计划、中国国家自然科学基金、合肥物理科学技术中心发展基金重大/创新项目和中科院先天免疫和慢性病重点实验室开放项目、中国科学技术大学生物信息学中心的支持。

原文链接:

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-018-1619-6#Sec1



END

内容为【iNature】公众号原创,欢迎转载

白名单回复后台「转载」



微信加群

iNature汇集了2万名生命科学的研究人员及医生。我们组建了40个综合群(8个PI群及32个博士群),同时更具专业专门组建了相关专业群(植物,免疫,细胞,微生物,基因编辑,神经,化学,物理,心血管,肿瘤等群)。温馨提示:进群请备注一下(格式如学校+专业+姓名,如果是PI/教授,请注明是PI/教授,否则就直接默认为在读博士,谢谢)。可以先加小编微信号(love_iNature),或者是长按二维码,添加小编,之后再进相关的群,非诚勿扰。



▼点击查看相关文章

影响因子|朱健康 | 汤富酬 | 张康李红良曹雪涛| 施一公

施扬|张锋|David Liu|胰腺癌 肺癌

免疫治疗|疼痛|CRISPR|m6A|lincRNA|GPCR

西南医科 | 上海交通 |万里学院|山大|安农

大学排名|科研基金|作者专访|导师选择|植物排行

风云榜 |中国最高引 突破10文章|有用邮件



iNature,专注前沿科学动态,传递科普信息。关注请长按上方二维码。投稿、合作、转载授权事宜请联系微信ID:18800248052 或邮箱:921253546@qq.com